Το Κ.Ε.ΠΕ.Α Φιλιατών Θεσπρωτίας απευθύνεται πρωτίστως στους νομούς Θεσπρωτίας, Ιωαννίνων, πρέβεζας, Άρτας, Κέρκυρας, Λευκάδας, Κεφαλονιάς και Αιτωλοακαρνανίας, από όπου δέχεται το 70% των σχολείων (περιβαλλοντικών ομάδων), το υπόλοιπο δε 30% από την υπόλοιπη Ελλάδα.
